Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms