Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA1Q9UJY5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms