Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH22Q9UJ99 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms