Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms