Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms