Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms