Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPN3Q9UHW5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms