Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
XCL2Q9UBD3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
XCL2Q9UBD3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms