Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRP2BPQ9P2M1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms