Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHD7Q9P2D1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms