Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms