Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIS18AQ9NYP9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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