Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms