Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL28Q9NXS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL28Q9NXS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms