Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms