Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A1Q9NWF4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A1Q9NWF4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A1Q9NWF4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A1Q9NWF4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A1Q9NWF4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC52A1Q9NWF4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC52A1Q9NWF4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms