Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMP3Q9NV31 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IMP3Q9NV31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms