Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms