Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms