Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRN4Q9NRL3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN4Q9NRL3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms