Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXMP2Q9NR77 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXMP2Q9NR77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms