Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRDM7Q9NQW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRDM7Q9NQW5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms