Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC31BQ9NQW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms