Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms