Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASCL3Q9NQ33 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms