Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA1Q9NP55 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIFA1Q9NP55 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms