Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms