Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK3Q9H422 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms