Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00597Q9H2U6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms