Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80BQ9C086 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms