Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF4Q9BZC1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms