Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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