Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms