Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms