Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDC1Q9BTX1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms