Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms