Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms