Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP8Q99708 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms