Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms