Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIN3AQ96ST3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms