Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCT8L2Q96SF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCT8L2Q96SF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms