Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRAMP1Q96RY5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms