Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms