Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms