Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85AQ96PX6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms