Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf49Q96NF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C8orf49Q96NF6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms