Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC114Q96M63 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms