Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SENP8Q96LD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP8Q96LD8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms