Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK3Q96L96 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms