Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPNS2Q96L46 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms